PFAS屬於環境荷爾蒙，

進入人體後會干擾正常的內分泌系統運作，可能導致膽固醇及肝酵素升高、睾丸癌、腎癌發生率增加、生育能力降低、免疫系統抑制及甲狀腺疾病，嬰幼兒暴露過量的全氟烷基化合物會導致新生兒出生體重下降、早產、神經發育及生殖功能障礙。

全氟烷基化合物包括數萬種物質，但目前國際癌症研究署（International Agency for Research on Cancer, IARC）僅將全氟烷基化合物中之全氟辛酸（PFOA）分類為Group 1「人類致癌物」，全氟辛烷磺酸（PFOS）分類為Group 2B「人類可能致癌物」。